Protein–RNA interactions for Protein: Q8R395

Commd5, COMM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd5Q8R395 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Commd5Q8R395 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Commd5Q8R395 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms