Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms