Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms