Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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