Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CntrobQ8CB62 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms