Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atg4aQ8C9S8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atg4aQ8C9S8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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