Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms