Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PgghgQ8BP56 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PgghgQ8BP56 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms