Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Lrrtm2Q8BGA3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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