Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-M10.5Q85ZW7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms