Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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