Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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