Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms