Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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