Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6aQ78XR0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6aQ78XR0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms