Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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