Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme8Q715T0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms