Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trak1Q6PD31 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trak1Q6PD31 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms