Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CltbQ6IRU5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms