Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3rf1Q69ZI1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3rf1Q69ZI1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3rf1Q69ZI1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3rf1Q69ZI1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3rf1Q69ZI1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sh3rf1Q69ZI1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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