Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

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Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Krt12Q64291 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt12Q64291 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms