Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim28Q62318 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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