Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nell2Q61220 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nell2Q61220 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms