Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms