Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Foxd4Q60688 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Foxd4Q60688 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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