Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms