Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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