Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Syne3Q4FZC9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Syne3Q4FZC9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Syne3Q4FZC9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Syne3Q4FZC9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Syne3Q4FZC9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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