Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dnah12Q3V0Q1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms