Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms