Protein–RNA interactions for Protein: Q30KP5

Defb18, Beta-defensin 18, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb18Q30KP5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defb18Q30KP5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb18Q30KP5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb18Q30KP5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb18Q30KP5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb18Q30KP5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb18Q30KP5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb18Q30KP5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb18Q30KP5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb18Q30KP5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms