Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd2Q149F1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rpusd2Q149F1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rpusd2Q149F1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rpusd2Q149F1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rpusd2Q149F1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd2Q149F1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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