Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp2b3Q0VF55 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms