Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tigd2Q0VBL1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms