Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms