Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tff1Q08423 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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