Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms