Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms