Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Thbs2Q03350 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms