Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gjb5Q02739 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gjb5Q02739 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms