Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms