Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms