Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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