Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms