Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nbr1P97432 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms