Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms