Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms