Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms