Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms