Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbdsP70122 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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